民国成立后自愿离去

中华民国成立后，孙中山就任临时大总统，陈粹芬功成而退，于1914年只身赴南洋，抱养一华侨女婴，平安度日。陈粹芬在述及与孙中山分手时说：“我跟中山反清，建立中华民国，我的救国救民愿望已经达到……我自知出身贫苦，知识有限，系自愿分离，并非中山弃我。中山对我不薄，也不负我。”1915年，孙中山与宋庆龄结婚，她说：“中山娶了宋夫人之后有了贤内助，诸事顺利了，应当为他们祝福。”1925年3月12日孙中山逝世，陈在南洋设坛遥祭7天。九一八事变后，陈应孙科之请，回香港定居，后迁广州。新中国成立前夕，陈粹芬返居香港，1960年病逝于香港，享年87岁。

将其写进孙氏族谱

孙中山与宋庆龄结婚后，曾多次写信给子女，均称呼陈粹芬 “二母亲”，要儿孙记住这位 “二母亲”。遗憾的是，粹芬与孙中山结婚10年，因革命生涯艰险，未能举行正式结婚仪式，也未能为孙家生下一男半女。但孙氏族人待粹芬如家人，称之为“陈夫人”，将其写进孙氏族谱。《翠亨孙氏达成祖家谱》记载，“元配卢慕贞（1915年离婚），侧室陈粹芬，妣宋庆龄”，在翠亨孙中山故居纪念馆内也按此规格展出。